曾桥,万志刚,肖建华,吴移谋,谭立志,万艳平,张文波,杨秋林,尹卫国,刘双全,胡四海.SARS病毒S蛋白部分片段B-细胞表位的多参数预测.[J].中南医学科学杂志.,2003,(4):373-378. |
SARS病毒S蛋白部分片段B-细胞表位的多参数预测 |
The Multi-parameter Prediction of B-cell Epitopes in Amino Acid Sequence Fragments of Spike Glycoprotein of SARS Coronavirus |
修订日期:2003-06-21 |
DOI: |
中文关键词: SARS病毒(SARS coronavirus) S蛋白(spike glyeoprotein) B-细胞表位 预测 |
英文关键词:SARS coronavirus,spike glycoprotein,B-cell epitope,prediction |
基金项目:湖南省教育厅“非典型肺炎”科技攻关重点基金资助项目 (No .2 0 0 3 99) |
曾桥 万志刚 肖建华 吴移谋 谭立志 万艳平 张文波 杨秋林 尹卫国 刘双全 胡四海 |
曾桥(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 万志刚(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 肖建华(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 吴移谋(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 谭立志(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 万艳平(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 张文波(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 杨秋林(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 尹卫国(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 刘双全(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001) 胡四海(南华大学,病原生物学研究所,湖南,衡阳,421001)
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目的预测SARS病毒S蛋白(spike glycoprotein)部分片段(aa No.400~600 & aa No.1 100~1 195)的B-细胞表位.方法应用多种参数和方法进行综合分析,包括跨膜分析、保守区分析、同源性比较、Hopp & Woods亲水性参数、抗原性参数、可及性参数、β-转角、万氏法等综合预测方法.结果显示B-细胞识别的表位可能在436~456和1 136~1 146残基或其附近,这两个被预测的表位均含有β-转角和不规则卷曲结构.结论本研究为应用合成肽抗原制备抗SARS病毒S蛋白抗体、诊断非典型肺炎(severe acute respiratory syndrome, SARS)提供了依据. |
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